Rozpočtové prostriedky, zdroje z Európskej únie a iné prostriedky zo zahraničia na financovanie rôznych projektov a rozpočtových potrieb budú mať jednotný systém kontroly. Vyplýva to z Koncepcie vnútornej finančnej kontroly vo verejnej správe, ktorú prerokovala a s pripomienkami schválila vláda na svojom stredajšom zasadaní.
Podľa slov ministerky financií Brigity Schmögnerovej režim finančnej kontroly by mal byť rovnaký bez rozdielu na to, či ide o prostriedky domácich daňových poplatníkov, alebo daňových poplatníkov z únie. Novou črtou v koncepcii je zavedenie kontroly „ex ante“ a požiadavky na auditovanie. Koncepcia prináša tiež rozšírenie kompetencií Ministerstva financií SR v rámci kontroly nakladania s rozpočtovými prostriedkami. „V súčasnosti sa v nadväznosti na koncepciu buduje kontrolný úrad, ktorý bude mať na starosti kontrolu zdrojov z EÚ,“ dodala ministerka.
Koncepcia prináša odporúčania na zlepšenie v legislatívnej, inštitucionálnej, personálnej, technickej a organizačnej oblasti systému finančnej kontroly. V súčasnosti parlament prerokúva zákon, ktorý zahŕňa rozšírenie kontroly NKÚ na prostriedky z EÚ.